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基因学苑文章列表(201906)

基因学苑 基因学苑 2023-08-18

不知不觉半年有过去了,这半年我们又更新了一部分内容,目前已经达到200多篇原创内容了,希望这些内容对大家有所帮助。

生信分析平台搭建专栏合集(CentOS系统)

生信平台搭建(一):购买腾讯云服务器

生信平台搭建(二):远程登录和设置

生信平台搭建(三):配置软件源和使用yum

生信平台搭建(四):利用yum进行基础环境配置

生信平台搭建(五):安装perl模块

生信平台搭建(六):python模块安装

生信平台搭建(七):R语言与Rstudio安装

生信平台搭建(八):R包的安装

生信平台搭建(九):目录设置

生信平台搭建(十):生物软件安装

生信平台搭建(十一):用户管理

生信平台搭建(十二):bashrc详解

生信平台搭建(十三):bioconda

生信平台搭建(十四):bioconda虚拟环境

生信平台搭建(十五):Aspera

生信平台搭建(十六):NCBI三大工具的安装与使用

生信平台搭建(十七):lftp下载基因组数据

生信平台搭建(十八):docker安装与使用

生信平台搭建(十九):搭建私有在线blast

生信平台搭建(二十):个性化设置

手把手教你生信分析平台搭建专栏合集(Ubuntu系统)

手把手教你生信分析平台搭建(一)

生信分析平台搭建(二):安装Linux系统

生信分析平台搭建(三):系统设置

生信分析平台搭建(四):共享文件夹

生信分析平台搭建(五):个性化设置

生信分析平台搭建(六):系统配置

生信分析平台搭建(七):bioconda

生信分析平台搭建(八):利用Synaptic安装生物软件

生信分析平台搭建(九):Aspera

生信分析平台搭建(十):Rstudio-server

生信分析平台搭建(十一):制作安装盘

生信分析平台搭建(十二):添加磁盘

生信分析平台搭建(十三):安装GNOME桌面

生信分析平台搭建(十四):用户管理

生信分析平台搭建(十五):RAID

生信分析平台搭建(十六):CentOS

生信分析平台搭建(十七):服务器配置

生信分析平台搭建(十八):如何选购服务器

生信分析平台搭建(十九):安装Galaxy

生信分析平台搭建(二十):常见问题


生物信息学习资源

生物信息神奇网站系列(一):R绘图Gallery

生物信息神奇网站系列(二):Python绘图Gallery

生物信息神奇网站系列(三):Seqanswers

生物信息神奇网站系列(四):Biostars

生物信息神奇网站系列(五):文件格式解析

生物信息神奇网站系列(六):Omictools

生物信息神奇网站系列(七):Mybiosoftware

生物信息神奇网站系列(八):SCI-HUB

生物信息神奇网站系列(九):批量下载序列

生物信息神奇网站系列(十):生物数据库集合

生物信息神奇网站系列(十一):CodeSchool

生物信息神奇网站系列(十二):机器学习数据集

生物信息神奇网站系列(十三):数据可视化Catalogue

生物信息神奇网站系列(十四):基因组大小统计

生物信息神奇网站系列(十五):R CheatSheets

生物信息神奇网站系列(十六):Notebook Gallery

生物信息神奇网站系列(十七):Bioconductor Workflows

生物信息神奇网站系列(十八):w3school

生物信息神奇网站系列(十九):已发表动物基因组列表

生物信息神奇网站系列(二十):已发表植物基因组列表

Linux学习

这个问题我回答超过1000遍
命令行的艺术
Linux命令行如何使用图形化软件
服务器就是一台高配置电脑吗?
微软WSL2来了,以后可以用windows做生信了?
Xshell6的正确打开方式
超级好用的文件传输命令rz与sz
看了Linux命令的全称,顿时豁然开朗

如何开启win10内置Linux子程序

比较一下几款常用的SSH工具

我为啥不爱回答你的问题
如何不间断连接服务器

如何随时随地连接服务器

如何在Linux下优雅的装X

求求你使用Tab键好吗

如何解决生物软件报错问题

一些压箱底的Linux技巧

一个空格引发的惨案

生物信息工作者的神器——mobaxterm

生物信息常用30个Linux命令(一)
生物信息常用30个Linux命令(二)
生物信息常用30个Linux命令(三)
这才是完美的生物信息软件安装方式

生物信息之独孤九剑——grep

生物信息之独孤九剑——sed

生物信息之独孤九剑——单行perl

生物信息之独孤九剑——sort

生物信息之独孤九剑——awk

生物信息之独孤九剑——vim

生物信息之独孤九剑——find

生物信息之独孤九剑——cut

生物信息之独孤九剑——xargs

不会编程,如何快速提取序列

不会编程,如何进行批量操作

不会编程,如何快速截取序列


生物软件系列

生物信息百Jia软件(一)——bwa

生物信息百Jia软件(二):fastp

生物信息百Jia软件(三):Muscle

生物信息百Jia软件(四):wgsim

生物信息百Jia软件(五):fastqc

生物信息百Jia软件(六):prodigal

生物信息百Jia软件(七):glimmer

生物信息百Jia软件(八):blat

生物信息百Jia软件(九):Mummer

生物信息百Jia软件(十):seqtk

生物信息百Jia软件(十一):svsim

生物信息百Jia软件(十二):trimmomatic

生物信息百Jia软件(十三):clustalw

生物信息百Jia软件(十四):velvet

生物信息百Jia软件(十五):rnammer

生物信息百Jia软件(十六):tRNAscan

生物信息百Jia软件(十七):flash

生物信息百Jia软件(十八):spades

生物信息百Jia软件(十九):cope

生物信息百Jia软件(二十):lumpy

生物信息百Jia软件(21):hisat2

生物信息百Jia软件(22):featureCounts

生物信息百Jia软件(23):SOAPdenovo

生物信息百Jia软件(24):trf

生物信息百jia软件(25):quast

生物信息百jia软件(27):三代数据拼接falcon

生物信息百Jia软件(28):canu
如何下载生物数据(一):生物数据检索
如何下载生物数据(二):利用ftp下载参考基因组
如何下载生物数据(三):GATK数据下载
如何下载生物数据(四):SRA数据下载
如何解决生物软件报错问题

生物信息基础

从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第1节 测序技术

从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第2节 FASTA和FASTQ
从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第3节 数据质控

从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第4节 构建WGS主流程

从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第5节 理解并操作BAM文件

GATK4.0和全基因组数据分析实践(上)
GATK4.0和全基因组数据分析实践(下)

GATK4全基因组数据分析最佳实践

生信分析必须了解的4种文件格式
造一台测序仪到底有多难?
这才是基因的正确定量方式
为什么生物信息分析难学?
生物信息重要资源站点
少废话,先完成一万行代码
这是一门好生意
当生物爱上计算机
讨厌的基因ID
你所不知道的各种seq技术
染色体分布图该怎么做

R语言系列

R内置数据集
你早晚都得学习R语言

学习R语言15句箴言,请牢记

Perl还是Python或者R

CentOS 7系统如何安装Rstudio-server

利用R绘制GO条目图

利用R实现vlookup

绘制manhanttan图

R内置数据集

常跟数据打交道,应该养成哪些好习惯?

点评一下市面上的R语言书籍

“双十一”坑人套路大揭秘——购物篮分析

办公软件

《提高效率,延长生命》系列征稿启事
OneNote for All
OCR神器CamScanner
经常出差,当然航旅纵横
OneDrive,真正的在云端
文档拍照扫描美颜神器Office Lens
win10全局剪贴板:多次复制,反复粘贴
午夜12点,办公室灵异事件……


杂文

生物学才是终极学科

入职华大基因是否是好的选择

不是我不明白,这世界变化快

能动手尽量别(biè)吵吵

生信信条

学习生物信息有且只有一种方法,那就是……

临床生物信息一站式解决方案

如何构建系统发育树

windows系统不能做生物信息吗?

《如何下载生物数据》视频教程已上线

生信视频教程正式上线腾讯课堂

这是一篇广告学习生物信息新途径

你们想要的数据处理软件在这里

《好莱坞电影中的基因科技》

关于人工智能的电影 ——附观看链接

为何外甥像舅舅,侄女像姑姑?

X战警与天赋基因检测

开卷有益

好坏公司鉴定标准

DNA告诉你,你从哪里来?

microbiomeViz:绘制lefse结果中Cladogram

微软12门免费人工智能课程

扩增子分析神器USEARCH简介

开源NGS可视化方案

未来,我需要这样一款基因搜索引擎

常跟数据打交道,应该养成哪些好习惯?

中国癌症大数据报告深度分析

CNV-seq分析介绍

国内学术会议和国际会议的十大差别

弱水三千,只取一瓢
未来,我需要这样一款基因搜索引擎
PPT做的好招谁惹谁了
五年后的基因测序行业应该是什么样子?
好好先生



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